É normal reparares nalgumas diferenças, sim, mas a boa notícia é que costumam ser diferenças de formatação e pequenos detalhes, não da estrutura no seu todo. A espinha dorsal que descrevi no tópico sobre a estrutura completa serve de base em praticamente todas as instituições em Moçambique, incluindo UCM, UEM e UP.

O que costuma variar de facto é a formatação, tipo e tamanho de letra, espaçamento entre linhas, margens, se a norma de citação exigida é APA ou outra, a nomenclatura de algumas secções (fundamentação teórica ou revisão da literatura, por exemplo, é a mesma coisa com nome diferente), o número mínimo ou máximo de páginas, e se exigem projecto separado antes da monografia final.

E às vezes até dentro da mesma universidade, cursos diferentes têm pequenas variações. Um curso de Direito e um de Gestão podem ter exigências ligeiramente distintas mesmo estando na mesma faculdade.

O conselho mais seguro que posso dar é usar a estrutura geral para te orientares enquanto escreves, mas confirmar sempre o regulamento oficial, ou perguntar directamente à secretaria do teu curso, para os detalhes finos de formatação antes de entregares. É rápido de confirmar e evita retrabalho de última hora.